João Guerra é doutorado em Ciências Sociais pelo ICS-ULisboa onde atualmente leciona no Programa de Doutoramento em Alterações Climáticas e Políticas de Desenvolvimento Sustentável. Na mesma instituição é investigador auxiliar e, nessa condição, membro do GI ATS – Grupo de Investigação de Ambiente, Território e Sociedade.

Desde 1998, João Guerra tem vindo a desenvolver numerosos projetos de pesquisa focados nas questões ambientais e nas suas interações com a sociedade, analisando os fenómenos sociais que resultam ou são influenciados por questões ambientais. No ano letivo 2018 foi Professor Visitante Estrangeiro no Programa de Pós-Graduação em Sociologia Política da Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis, Brasil. Fora da academia é, ainda, membro da Comissão Nacional do ECO XXI (ABAE-FEE), projeto que anualmente avalia características e práticas de sustentabilidade entre os municípios portugueses.